Quand le lycéen Ichigo est soudain investi de pouvoirs de shinigami, il aimerait les rendre... Mais il va tout d'abord devoir récolter quelques âmes.

L'histoire prend place dans une petite ville nichée dans les montagnes. On y suit le quotidien d'Aoi, sa sœur Akane, son ex-petit ami guitariste Shinnosuke Kanomura et un jeune Shinno... qui n'est autre que le Shinnosuke du passé, âgé de 13 ans. Il y a 13 ans, les parents d'Aoi et Akane sont décédés et aujourd'hui, les deux jeunes filles vivent seules ; Akane, la grande-sœur, a renoncé à son rêve d'aller vivre à Tokyo pour subvenir aux besoins de sa cadette. Musicienne en herbe, Aoi est un jour invitée à venir se produire sur scène par un célèbre chanteur d'enka du nom de Dankichi. Au même moment, Shinnosuke, qui avait disparu quelques temps, refait son apparition dans les vies des deux sœurs... et Shinno aussi. Pour la première fois, Aoi va sentir son cœur battre pour quelqu'un.

Les Yorozuya vont chasser des scarabées dans la forêt. Par hasard, ils rencontrent le Shisengumi. Après plusieurs péripéties, Okita previent Gintoki qu'un tsujigiri (personne qui teste l'efficacité de son nouveau katana en s'attaquant à un adversaire humain) s'en prend à de nombreuses personnes. Au même moment, Gintoki reçoit une requête : il doit retrouver le voleur du Benizakura, un sabre qui serait maudit...

À 26 ans, Takemichi a le sentiment d'avoir déjà raté sa vie. Vivotant de petits boulots ingrats tout juste bons à payer le loyer d'un studio miteux, il se lamente sur le désert de sa vie amoureuse lorsqu'il apprend la mort de Hinata, la seule petite amie qu'il ait eue... La jeune fille et son frère ont été les victimes collatérales d'un règlement de comptes entre les membres d'un gigantesque gang, le Tokyo Manji-kai. Encore sous le choc, Takemichi est à son tour victime d'un accident qui le ramène inexplicablement 12 ans en arrière, lorsqu'il était au collège et se donnait des airs de mauvais garçon. Et si c'était pour lui l'occasion de sauver Hinata ? Mais en tentant de modifier le futur, Takemichi se retrouvera inexorablement mêlé aux complots se tramant autour du Tokyo Manji-kai et de son charismatique et mystérieux leader...

Durant la dynastie Qin, pendant la période des états belligérants dans la Chine ancienne, Shin était un orphelin de guerre. Il rêve de devenir un grand général. Shin rencontre le jeune roi Eisei qui vise à unifier toute la Chine.